Lead optimization

小分子共价抑制剂是一类通过共价键与靶点结合来发挥其生物学功能的抑制剂。与非共价抑制剂相比，共价抑制剂在生物活性方面具有明显优势，共价弹头靶向特定靶蛋白的稀有残基，可以用于开发高选择性抑制剂。

近年来，随着一系列共价抑制剂的成功问世，特别是针对那些传统上被认为难以成药的受体，如 EGFR、BTK、KRAS 的抑制剂，以及共价抑制剂在解决耐药性问题方面表现出显著优势，共价抑制剂已然成为小分子药物研发的热点。但是此类抑制剂一旦出现脱靶，也将带来更强的毒副作用。因此，通过合理的筛选设计和结构修饰发现共价抑制剂药物也逐渐成为一个药物研发的焦点。

MCE 类药共价化合物库含有 1,049 个共价分子，这些分子包含共价反应常用的弹头，如丙烯酰胺、活化末端乙炔、酰基氧甲基酮、硼酸等，可以与半胱氨酸、赖氨酸、丝氨酸和组氨酸等发生共价反应，是筛选共价化合物的有利工具。

肾脏是人体的重要器官之一，因暴露于更高浓度的循环药物或代谢物时，极易发生药物性肾损伤。据统计，药物诱导的肾损伤约占肾毒性报告的 20%，可导致急性肾损伤、慢性肾病或终末期肾病的发生。早期识别药物肾毒性对预防不可逆肾损伤至关重要，其机制研究有助于临床用药优化，通过调整剂量或避免肾毒性药物联用。另外，在早期药物开发中能预测药物肾毒性，降低后期研发失败风险。

MCE肾脏毒性库可提供 0 种经 FDA 明确报道的肾损伤相关药物，可用于肾毒性分子机制研究或新型生物标志物的开发。

一个具备良好的ADMET（吸收、分布、代谢、排泄和毒性）特性的多样化合物库在药物发现中至关重要。通过在药物发现早期对ADMET性质进行评估，能够有效筛选掉那些具有不良ADMET特性的分子，从而降低后期研发失败的风险和研发成本，加速先导化合物优化。 基于ADMET 相关AI算法预测，该库化合物预计具有良好的口服生物利用度（F>30%），合理的血浆蛋白结合率（PPB<98%）,并且在代谢方面旨在最小化对CYP3A4的抑制作用（CYP3A4是细胞色素P450家族中最为重要的药物代谢酶），预计对CYP3A4有抑制作用的概率低于50%，以及比较低的毒性。通过整理140个有潜在毒性的子结构，并利用子结构匹配剔除可能有潜在毒性的片段的化合物，进一步确保了化合物库的安全性。库中化合物结构多样，可以广泛用于高通量筛选（HTS）和高内涵筛选（HCS）。

靶向蛋白降解(Targeted protein degradation, TPD)是一种新型的、有前景的新药研发方法，旨在通过标记降解或招募天然降解机制，靶向那些因缺乏酶功能、缺乏药物结合位点而被认为不可药物的蛋白质。

分子胶是一种小分子降解剂，主要诱导E3泛素连接酶与靶蛋白之间发生新型相互作用，形成三元复合物，进而导致蛋白质泛素化，最终被蛋白酶体降解。与PROTACs相比，分子胶通常具有更低的分子量，更高的细胞通透性和成药性。此外，分子胶的设计相对简单，不需要复杂的连接子和配体优化。因此，分子胶已经逐渐成为一种具有前景的疾病治方法。

目前已报道出多种类型的分子胶，通过对共晶结构进行分析发现，CRBN相关的分子胶更通用，因此我们选择了相关的活性分子作为探针分子用于人工智能（AI）筛选，再通过分子对接，验证筛选出的分子保持关键的药效团，最终获得320个分子胶类似物，这些化合物是研究分子胶的有力工具。