病毒宏基因组学方法能检测出还处在潜伏期的新兴病毒吗?
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可以发现。 早期的一些传统研究方法的应用受到限制,不能完全满足病毒研究的需要。如电镜观察病毒的灵敏性不高,细胞培养病毒可能观察不到细胞病变,血清学反应中不但难以获得高价抗体而且容易出现交叉反应导致错误结果,传统PCR方法对未知序列及高变异的病毒研究难行相演热浓图稳又以发挥作用。加之近年被附属阶来病毒流行病的频繁发生及其可怕的传染性,对人类及动植物的健康产生严重威胁,如HIV病毒、SARS病毒、禽流感病毒和在西非等地肆虐的埃博拉病毒[4]等,360问答给人们造成了巨大的恐慌和经济立号衡境损失。因此,对病毒基因组的研究、致病源的探索、病毒在生物体和环境中如何存在及传播、病毒病防治的研究误县练已迫在眉睫。
随着时代的发展和生物科学技术的进步,新兴的病毒宏基因组岩早滑补担粒学为解决这些问题提供了契机,宏基因组学(Metagenomi胜最孩婷比叶cs)的概念是1998年由Handelsman[5]首次提出,对特定环境中基因组的总和进行研究,包括培养的和未培养的微生物。病毒宏基因组学(Viral 亚怕长虽染么磁止实打metagenomics)就是宏基因组学在病毒领域的应用,即从环境或生物组织中浓缩病毒粒子的遗传物质进行生物学信息分析的技术。它的应用需要一些交叉学科的创新技项东了掌宜袁显解同步促术的支持,随机引物PCR和新一代测序技术---高通量测序的应用大大提高了研究的效率和获取信息的丰度犯燃原露钟,克服大环境中病毒浓度低、易受干扰的不足,拓展了病毒宏基因组学的应用范围边审事钟令承弱黑拉六座和现实作用,为探索未知病毒提层逐收混及利重听比供广阔的前景和应用空间。在人类预防疾病、开发疫苗方面具有重大贡献。
传统方法只能以已知病毒为目标,难以发现新病侵敌费酸区迫却跟毒,而病毒宏基因组学方法结合新一代测序技术和随机PCR1的病毒;研究的病毒直接从环境中获取,不需要分离培养;可以对环境中过于分散、外丰度低的病毒进行系统分析和鉴定。
局限
应用病毒宏基因组学方法进行研究,依然存在一些问题需要进一步探索,如从大另停鸡移补袁直找发环量环境中提取样本方式,随机扩增方法和引物的选择能否做到无偏差覆盖所有病毒,海量测序数据的处理,依赖样品复杂度的生物信息分析等。
3.1临床应用
2008年[16]病毒宏物每头承基因组学在人体临床检查中第一次应用,结合深度测序检测器官移植相关的致死疾病的病原体。利用病毒宏基因组学依谓侵心穿型收还对人体的唾液、呼吸道、血液、排泄物的检测分析,可季轴川简活混身只角以发现未知和潜在的致病病毒。
Law等对一些肝病患者的血浆进行研究,发现病毒危纸式制亚宜士来极时效宏基因组学方法快速准确,还能将检测范围扩大到其它体液。
单同领根据病毒宏基因组学的方法分析了儿童和猪肠道病毒群落,并且确定了致病原的信息。
Zhang等应用宏基因组学在人的粪便中发现了大量的植物病毒。
Willner等应用宏基因组学分析了健康和呼吸道感染的人的呼吸道分泌物中的DNA病毒群落。
2010年在没有先验信息的条件下,应用病毒宏基因组学获得了流感病毒的全部基因。研究者还通过监测特定区域内已知传染人、动植物病毒的昆虫媒介携带的病毒[22],来检测相关病毒的流行和预防,为突发病原体的鉴定提供方向。蝙蝠作为很多人兽共患病(例如埃博拉病毒、严重急性呼吸系统综合征(SARS)病毒和x帕病毒)的自然传播宿主,故蝙蝠体内的病毒多样性成为学者研究的热点。
2010年,Li等和Donaldson等应用病毒宏基因组学的方法分别研究了北美蝙蝠粪便中的病毒群落。发现了大量新的哺乳动物病毒、昆虫病毒和植物病毒,Donaldson还发现了一株新的冠状病毒。
2013年,杨凡力等应用病毒宏基因组学的方法研究吉林、云南、湖南采集的蝙蝠组1小双节RNA病毒、圆环病毒等新病毒。
2000年用病毒宏基因组学方法对埃博拉病毒进行了鉴定
从中可以得知潜伏期的新兴病毒是可以被检测出来的