蛋白组是指细胞内全部蛋白的存在及活动方式，即基因组表达产生的总蛋白质的统称。
功能蛋白质组指那些可能涉及到特定功能机理的蛋白质来自群体，主要研究方法为蛋白质双向电泳。通过高效液相色谱、质谱对蛋白质序列进行分析，再借用分子生物学的手段则可以进行目的基因的分离。
如应用PCR进行分离目的基因；通过对蛋白质的序列分析，可以通过密码子的简并性设计简并引物，可利用RT-PCR得到目乙担职兰的基因的全长；应用核酸杂交筛选法分离目的基因，即利用简并寡核苷酸探针筛选cDNA或基因组文库；免疫学筛选法分离目的基因是通过蛋白的特异抗体与目的蛋白的专一结合，从表达文库中分离需英考乡目的基因的蛋白基因。
