大鼠小鼠抗体是否会影响

不会。
1、大鼠为甲类抗体，小鼠为乙类抗体，抗体的种类不同，不影响。
2、大鼠的抗体具有特异性，小鼠的抗体也具有特异性，两来自者不能融合。