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抗藥性金黃色葡萄球菌（Methicillin-resistant Staphylococcus aureus或Multiple-resistant Staphylococcus aureus，簡稱MRSA）是金黃色葡萄球菌的一個獨特菌株，能抵抗所有青黴素，包括甲氧西林及其他抗β內醘胺酶的青黴素。
MRSA首次發現於1961年的英國，現時已廣泛散播，在醫院中牠更被稱為「超級萬古黴素及替考拉寧是用來治療MRSA感染的勝肽幾丁聚醣抗生素。替考拉寧是與萬古黴素在結構上同類及有著相似的抗菌性，但半衰期卻更長。兩種藥物的口服吸收都較低，所以都是以靜脈注射方式用藥。但例外的是假膜性結腸炎，萬古黴素必須要以口服來治療這種腸胃道感染。
MRSA的幾種菌株都有抗藥性，甚至是萬古黴素及替考拉寧。那些新進化的MRSA稱為萬古黴素敏感性減低金黃色葡萄球菌（Vancomycin intermediate-resistant Staphylococcus aureus，簡稱VISA）
利奈唑胺、奎奴普丁－達福普丁、達托黴素及替加環素都是最近新進用作治療的藥物，一般用在對勝肽幾丁聚醣抗生素沒有反應的嚴重感染上。較輕微的感染可以用口服的製劑來治療，包括利奈唑胺、立汎黴素及夫西地酸、原始黴素、增效磺胺甲基異噁唑（甲氧芐啶和磺胺甲噁唑合劑）、脫氧羥四環黴素及克林黴素。
於2006年5月18日，默沙東刊登了一項研究，發現一種全新的抗生素稱為平板黴素，能有效地殺死MRSA
