大片段测序

特点
→ 技术平台：Shotgun测序策略；3730xl测序仪；生物信息分析
→ 适用范围： Fosmid、Cosmid、病毒等等

原理
鸟枪策略(shotgun strategy)又称随机测序策略，此策略是将大片段DNA用机械方法随机切割成2Kb左右的小片段，把这些DNA片段装入适当载体，建立亚克隆文库，从中随机挑取克隆片段。最后通过克隆片段的重叠组装确定大片段DNA序列。

服务流程
1) 对纯化的大片段DNA(如Fosmid等)用物理方法进行切断处理，随机切成2.0 Kb左右的小片段；
2) 将小片段各自克隆于测序载体中；
3) 对大量小片段进行测序，达到8～10倍左右的高覆盖率；
4) 应用生物信息学软件将相互重叠的读出序列组装成连续的最小重叠群(contig)；
5) 从质量最高的读出序列中取得确认序列；
6) 通过引物延伸或其他方法填补最小重叠群之间的缝隙。

客户提供
→ 请提供足量的新鲜样品(4°C保存，不超过一天)或将新鲜样品立即存于液氮或-80°C后保存不超过一个星期。
→ 注意：如果需要从建库开始，且用植物样品建基因组文库，为了降低文库中的叶绿体污染，样品须是植物的黄化苗嫩芽。

我们提供
电子版测序结果，原始库测序峰图文件(abl.或scf. 格式)，序列文件(seq.格式)，序列相关信息，信息统计，分析结果统计表格等。可提供两种级别：精细图和完成图。

质量保证
→ 精细图所有的contig位置确定，gap少于5个
→ 完成图拼成一条完整序列，错误率低于万分之一

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