通用原核生物 RNA-Seq 试剂盒

询价
Allegro
2021-06-11 17:55

帝肯(上海)贸易有限公司

我要认领
帝肯(上海)贸易有限公司
Tecan
021-22063206
info.cn@tecan.com
产品属性
英文名通用原核生物 RNA-Seq 试剂盒
CAS号
供应商帝肯(上海)贸易有限公司
产品说明
适用于菌群研究的宏转录组文库制备完整方案
使用 AnyDeplete™ 技术的通用原核生物 RNA-Seq 文库制备试剂盒为微生物 RNA 测序提供了一种简单的“加样 + 孵育”系统。这种链特异性 RNA-Seq 剂盒为纯培养物或混合细菌群提供了完整的文库构建方案。集成的 AnyDeplete 技术可以从多种原核生物中消除 rRNA,使序列包含的信息更丰富,同时降低测序成本。

该试剂盒的主要优势
1. 广泛的 RNA 起始量(100 – 500 ng
2. 支持多类型的纯化 RNA:细胞系、环境样品、微生物组
3. 可搭配 AnyDeplete 技术以定向去除转录本,从而使可用的测序数据最大化
4. 兼容多种 GC 含量的样品


1:制备 Illumina 兼容的文库的简化工作流程,用于微生物 RNA 测序研究。

应用
微生物组研究
环境样品
全转录组分析
基因差异表达
• RNA 测序

2:定向去除 P. gingivalis rRNA。靶向 rRNA 的物种特异性探针可以将 rRNA 序列的数量从 90% 减到 10%,使信息丰富的序列占比显著增加。

通用原核生物 RNA-Seq 文库制备试剂盒已经被全球的科研人员成功用于制备高质量的全转录组文库,并在同行评审的期刊上发表了多篇文章:

1. 使用通用原核生物 RNA-Seq 制备测序文库以最大化信息丰富的序列,用于识别受植物免疫激活影响的细菌转录组特征。
Nobori, T et al. Transcriptome landscape of a bacterial pathogen under plant immunity. PNAS, 2018, 115(13), E3055-E3064. doi: 10.1073/pnas.1800529115

2. 使用从通用原核生物 RNA-Seq 文库制备试剂盒获得的高质量测序数据开发了一种新的 RNA-Seq 据标准化方法。
Berghoff, BA et al. RNA-sequence data normalization through in silico prediction of reference genes: the bacterial response to DNA damage as case study. BioData Mining, 2017, 10, 30. doi:10.1186/s13040-017-0150-8

3. Tecan 的通用原核生物 RNA-Seq Ovation 超低DNA-Seq 文库制备试剂盒成功地帮助了对未开发的多种生态系统中的微生物种群进行全面分析。
Fortunato, C et al. Spatially distinct, temporally stable microbial populations mediate biogeochemical cycling at and below the seafloor in hydrothermal vent fluids. Environmental Microbiology, 2017, 20(2), 769-784. doi: 10.1111/1462-2920.14011

4. 定制的 AnyDeplete 探针在白蚁 —— 细菌肠道共生 研究中有效去除了 rRNA
Peterson, BF & Scharf, ME. Metatranscriptome analysis reveals bacterial symbiont contributions to lower termite physiology and potential immune functions. BMC Genomics, 2016, 17(1), 772. doi:10.1186/s12864-016-3126-z
订货信息