Gboxin 是一种氧化磷酸化 (OXPHOS) 抑制剂，可靶向抑制胶质母细胞瘤生长。Gboxin 抑制 F0F1 ATP 合成。具有抗肿瘤活性。

BTB06584 是一种选择性的且依赖 IF1 的线粒体 F1Fo-ATPase 抑制剂，且不影响 ATP 的合成。BTB06584 可延迟缺血性细胞死亡。

Mtb ATP synthase-IN-1 (compound 6ab) 是一种有效的 结核分枝杆菌 (Mtb) ATP 合成抑制剂，对 Mtb 的 MIC 为 0.452 ~ 0.499 μg/mL。Mtb ATP synthase-IN-1 代谢稳定性好，细胞毒性低 (Vero IC50 > 64 μg/mL)，具有一定的口服生物利用度。Mtb ATP synthase-IN-1 可用于抗结核分枝杆菌的研究。

D-α-Hydroxyglutaric acid disodium (Disodium (R)-2-hydroxyglutarate) 是神经代谢疾病 D-2-羟基戊二酸尿症中积累的主要代谢产物。D-α-Hydroxyglutaric acid disodium 是 α-酮戊二酸 (α-KG) 的弱竞争拮抗剂，可抑制多种 α-KG 依赖性双加氧酶 (dioxygenases)，Ki 为 10.87 mM。D-α-Hydroxyglutaric acid disodium 可增加活性氧 (ROS) 的产生。D-α-Hydroxyglutaric acid disodium 还可结合并抑制 ATP 合酶并抑制 mTOR 信号传导。

D-α-Hydroxyglutaric acid ((R)-2-Hydroxyglutarate) 是神经代谢疾病 D-2-羟基戊二酸尿症中积累的主要代谢产物。D-α-Hydroxyglutaric acid 是 α-酮戊二酸 (α-KG) 的弱竞争拮抗剂，可抑制多种 α-KG 依赖性双加氧酶 (dioxygenases)，Ki 为 10.87 mM。D-α-Hydroxyglutaric acid 可增加活性氧 (ROS) 的产生。D-α-Hydroxyglutaric acid 还可结合并抑制 ATP 合酶并抑制 mTOR 信号传导。

Apoptolidin 是从 Nocardiopsis 细菌中分离得到的一种聚酮类化合物。Apoptolidin 是一种选择性线粒体 F1FO ATPase 抑制剂。Apoptolidin 是一种凋亡 (apoptosis)诱导剂，可诱导腺病毒型 12 癌基因(包括ElA) (IC50=10-17 ng/ml) 转化的细胞凋亡，但不诱导正常细胞的凋亡。

ATP synthase inhibitor 2 是一个铜绿假单胞菌 (PA) ATP synthase 抑制剂 (IC50=10 μg/mL)，在 128 μg/mL 时可完全抑制铜绿假单胞菌 (PA) 的 ATP 合成活性。

Oligomycin B 是一种从链霉菌属中得到的抗生素，为真核生物 ATP 合成酶 (ATP synthase) 抑制剂，可诱导凋亡。

Oligomycin A (MCH 32) 是从链霉菌属中得到的一种线粒体 F0F1-ATPase 抑制剂，Ki 值为 1 μM；Oligomycin A 具有抗真菌的功能。

Abyssinone V 是一种异戊二烯化类黄酮，具有预测的抗病毒活性。Abyssinone V 可以从 Erythrina melanacantha 的茎皮中分离出来。Abyssinone V 具有良好的药效学特性。Abyssinone V 被预测为抗病毒剂，包括抗疱疹 (HSV)。其机制包括抑制聚合酶、ATP 酶和膜完整性。

Venturicidin A (Aabomycin A1) 可从放线菌类中得到，是一种 ATP 合酶抑制剂，可增强氨基糖苷类抗生素庆大霉素对葡萄球菌、肠球菌和铜绿假单胞菌的耐多药临床分离株的抵抗力。Venturicidin A对人胚胎肾 (HEK) 细胞具有明显的毒性，IC50 为 31?μg/mL。

Venturicidin B (Aabomycin A2) 是一种从链霉菌中分离出来的大环内酯类抗生素，可用作抗真菌剂，线粒体 F0-ATP 合成酶(ATP synthase)复合体的有效抑制剂。

Bongkrekic acid 是一种由假单胞菌分泌的线粒体毒素 (mitochondrial toxin)。Bongkrekic acid 是线粒体腺嘌呤核苷酸 (ADP/ATP) 转位酶 (ANT) 的特异性配体而不是电子传递链的。Bongkrekic acid 必须通过线粒体内膜产生抑制 ADP/ATP 转运的作用。

ATP synthase inhibitor 1 是一种 F1/FO-ATP 合酶复合物 c 亚基的有效抑制剂，抑制线粒体通透性转换孔的开放，但不影响 ATP 的水平。

Oligomycin 是一种抗真菌抗生素，是 H+-ATP 合成酶的抑制剂。Oligomycin 断氧化磷酸化和电子传递链。Oligomycin 抑制缺氧性肿瘤细胞 HIF-1alpha 表达。