有几种不同的染色剂可用于观察和拍摄凝胶电泳分离后的 DNA。染料分子附着在 DNA 链上，在紫外光下发出荧光，显示凝胶中的条带位置。Hoechst 染色剂是用于染色 DNA 的蓝色荧光染料家族中的一员： 有三种相关的 Hoechst 染色剂：Hoechst 33258、Hoechst 33342 和 Hoechst 34580。Hoechst 33258 和 Hoechst 33342 是最常用的染料，它们具有相似的激发/发射光谱。