基质金属蛋白酶（MMPs）是依赖锌的内肽酶。MMPs属于一个更大的蛋白酶家族，被称为甲状腺素超家族。MMPs能够降解各种细胞外基质蛋白，但也能处理一些生物活性分子。已知它们参与了细胞表面受体的裂解、凋亡配体的释放和趋化因子/细胞因子的失活。MMPs还被认为在细胞行为上发挥着重要作用，如细胞增殖、迁移、分化、血管生成、凋亡和宿主防御。MMP-2和MMP-9被认为在转移中很重要。MMP-1被认为在类风湿性关节炎和骨关节炎中很重要。最近的数据表明，MMPs在主动脉瘤的发病机制中发挥了积极作用。过量的MMPs会降解主动脉壁的结构蛋白。MMPs和TIMPs之间的平衡失调也是急性和慢性心血管疾病的一个特征。