羧基肽酶(Carboxypeptidase)是一种蛋白酶，在蛋白质或肽的羧基端（C端）水解（裂解）肽键。与氨基肽酶形成对比，后者在蛋白质的另一端裂解肽键。人类、动物和植物含有几种类型的羧基肽酶，它们具有从分解到蛋白质成熟的不同功能。羧肽酶的功能涉及食物的消化、神经内分泌肽的生物合成、血液凝固、生长因子的产生、伤口愈合、繁殖和许多其他过程。