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基因表达谱分析所采用的常用方法是聚类,其目的就是将基因分组.从数学的角度,聚类得到的基因分组,一般密议历是组内各成员在数学特征上彼此相似,但与其它组中的成员不同.从生物学的角度,聚类来自分析方法所隐含的生物学意360问答义或基本假设是,组内基因的表达谱相似,它们可能有相似的功能开传原化半养杆大长.然而,产物有相同功能的编码基因（例如对其它蛋环呢白质有磷酸化作用）,不一定共享相似的转录模式.相反,有不同功能的基因可能因为巧合或随消危机扰动而有相似的表达谱.尽管有许多意外的情况存在,大量功能相关的基因的确在相关的一组条件下有非常相似的表达谱,特别是被共同的转录因子共调控的基因,或者产物构成同一个蛋白复合体,或者参与相同的调控路径.因此,在具体的应用中,可以根据对相似表达谱的基因进行聚类,从而指派未知基因的功能.
