离子对试剂是由强亲水离子形成,反作用于样品分子的中性离子对。因此,可用于同时分离带电分子和非带电分子。一般做反相液相色谱时,好多时候物质极性太强就用离子对色谱法,这样会改变分离机理,使物质有所保留。当在反相条件下用于常见的憎水性HPLC固定相时,离子对试剂可选择性的增加带电荷分析物的保留时间
十二烷基磺酸钠,辛烷磺酸钠,庚烷磺酸钠这些都是用于碱性化合物,其它链越长,极性越弱,那分离作用也不会一样,对于不同的物质分离情况不一样,增加了分离的选择性。