细胞生物学23

真核生物rRNA的成熟过程现在已经搞得比较清楚了。哺乳动物的初级转录本是一条45SRNA链。含有18S，5.8S和28SrRNAs。它含有约110个甲基，这是在转录过程中或刚刚转录好时加工上去的。几乎所有甲基均连接在核糖残基上，在被加工成熟的rRNAs中，这些甲基全部被保存。在成熟的18SrRNA上有约39个原来的甲基，只有4个是后来在细胞浆中加上去的。而在28SrRNA中有约74个甲基，全部是原来的。有人认为甲基的存在是初级转录本转变成熟的rRNA的标志。
成熟的途径可能不止一条，因为中间产物的长度在不同途径中是不一样的，然而最终产物都是一样的，其中两条途径(HeLa途径和L途径)切割的位置是[1]18S基因的5'则，[2]18S和5.8S基因之间的间隔区(soqacer)，和[3]5.8和28S序列之间的间隔区(5.8S序列成为一个和28SrRNA通过碱基配对相结合的小RNA)。
细菌的rRNAs也是通过切割其共同前体形成的。E.coli的七个编码rRNA的操纵子称为rrnA-G.它们在染色体上并不相连锁.每个操纵子均转录为一个RNA前体，然后被切割为成熟的rRNA分子。这些rrn操纵子的组成基本相同，均含有顺序为16S-23S-5S的三个rRNA分子。
两个主要的rRNA(16S和23S)之外，还有一个5SRNA存在于同一转录本中。所有rrn操纵子均有双重启动子结构。第一个启动子(P1)位于16SrRNA序列起始位点的上游约300bp处。P1可能是主要的启动子。在P1的右方约110bp处是第二个启动子。在16S和23SrRNA之间的序列是一个400-500bp的转录间隔区，在此区内有编码tRNA的序列。在4个rrn操纵子中，此转录间隔只含一个tRNA序列，即tRNAGIU。而在另外三个rrn操纵子中，此间隔区含有两个tRNA序列，即tRNAIie和tRNAASP。不同rrn操纵子中之间的另一个差别是，有的操纵子的前体RNA的末端序列编码5SRNA，而另一些操纵子则还要编码rRNA。例如在rrnC的3'端是两基因:tRNATrp和tRNA1ASP。所以rrnC操纵子对E.coli是非常重要的，因为这是唯一的tRNATrp基因，能使细菌能应用色氨酸合成蛋白质。
加工rRNA的酶是RNA酶Ⅲ。在rne-细胞中缺乏成熟的rRNAs，而代之以含有16S，23S和5S序列的一个30S前体。这种前体在体外能被RNA酶Ⅲ所切割而形成成熟的rRNA分子。16S和23SrRNAs的前体分别称为p16和p23，它们分别比16S和23S略长一些。在初级转录本中，由于p16p23的两端的碱基都是互补的，它们分别形成很大的发夹。其特征是发夹顶的环非常大，分别为1600个核苷酸和2900个核苷酸。