在dna测序的时候在开始的阶段出现了很多的aaa然后再后面的峰就比较小了 为什么 我用的是m13f 做的引物

这个，取决于你所测的片段的来源吧。 Poly A很可能是RT-PCR中使用了Oligo d(T)的结果，当然也可能是DNA片段本身就含有一部分连续的A，还可能是测序公司的失误。 你应该使用的是PCR后连接载体后扩增出的重组质粒进行测序的。这样M13F是从一侧对插入片段进行测序。这边如果有问题，那么就可以使用M13R，也就是另一侧进行测序。这样就可以避开那段Poly A，让测序结果更加可信一些。 说实话，你的问题中信息太少，很难做出太准确的回答。