主要结合dsDNA；结合小沟的AT。DAPI也结合RNA，但其发射峰波长（500nm）要长于DAPI/dsDNA（460nm）。
DAPI dilactate更水溶。在用于组织染色、未固定细胞和组织染色时，下述方法可加以修改。
保存：
10mg/单位，室温避光保存，小瓶内至少一年。制stock液，溶解100uM （DAPI dihydrochloride二盐酸化物分子量为350.3；DAPI dilactate分子量为457.5）DAPI于去离子水中或DMF(二甲基甲酰胺)，4℃避光可保存6个月。
DAPI是诱变剂，水溶液可通过活性炭去除，要安全处理。
染色：
在所有染色完成后进行复染，不需要另外的固定和通透处理。
