单细胞之富集分析-3:GO和KEGG富集分析及绘图

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单细胞富集分析系列:

单细胞富集分析我最常用的是 分组GSVA ,但最近用到了GO分析,就复习一下GO和KEGG富集分析及绘图。

载入无比熟悉的pbmc.3这技万章曾办攻额艺支来k数据集 (已注释好,含身世只数据准备见 monocle )

pbmc3k数据集只有1个样本,没办法区分HC和病例组。
处世同将若有分组,可以使穗亮轿用sub而如氧单也纸目set函数将某种细胞取出,键雀来做这种细胞病例组和对照组相比的差异基因和富集分析

之所以长短不齐不按顺序是零晶觉斯么院烧因为没有排序

排完续之后始构再画p值就是按顺序的

附: 单细胞测序数据的差异猜肆表达分析方法总结

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