可以分解难溶性磷化合物的微生物种类很多，也比较复杂。有人根据它们分解的底物，将它们分为分解有机磷的微生物和分解无机磷的微生物，但这种划分的根据并不十分充分。目前研究和应用的主要有以下属中的一些种。
芽胞杆菌属（BACILLUS）如巨大芽胞杆菌（***.megatherium）、枯草芽胞杆菌（***.su***tilis）、矮小芽胞杆菌（***.pumilis）、短小芽胞杆菌（***.***reⅥS）、环状芽胞杆菌（***.circulans）、蜡状芽胞杆菌（***.cereus）、胶冻样芽胞杆菌（***.mucilaginosus）；
类芽胞杆菌属（PANIBACILLUS）如多粘类芽胞杆菌（***.***olymyxa）；
假单胞菌属（PSEUDOMONAS）如荧光假单胞菌（***.fluorescens）、放射假单胞菌（***.radiobacter）、草生假单胞菌（***.herbcola）、纤细假单胞菌（***.gracilis）；
节杆菌属中的一些种ARTHROBACTER SPP.
色杆菌属中的一些种CHROMOBACTERSPP.
分枝杆菌属（MYCOBACTERIUM）中的一些种；
氧化硫硫杆菌THIOBACILLUSTHIOOⅪDANS
类芽胞杆菌属（PAENIBACILLUS）中的一些种；
真菌的某些种类：如拜莱青霉（Penicillum bilaii）。
生产中应用最早、目前应用最广的解磷微生物是巨大芽胞杆菌（***.megatherium）。典型的巨大芽胞杆菌的特征是：革兰氏染色阳性，严格好氧；在营养琼脂培养基上，细胞柱状到椭圆或梨形，菌体大小一般为宽1.2～1.5微米、长2～5微米，趋于扭曲短链；在孢子囊内形成不多于1个的抗热芽胞，为中生到端生，形状为椭圆形或圆形不等；菌落生长丰富，不扩展，有光泽或较暗，有时微皱，生长后期一般带黄色，长时间培养生长物和培养基可变成褐色或黑色；接触酶阳性；水解淀粉和酪素；V-P反应和卵黄反应阴性。
值得注意的是，蜡状芽胞杆菌、假单胞菌中有一些种是动、植物病原菌，所以对此类微生物作为生产菌种应有明确的鉴定，至少须鉴定到种，确定是非病原菌后才能应用。解磷真菌由于工业化生产问题未能很好解决，使用受到一定的限制。
