染色质免疫沉淀 分离出来的DNA序列怎么设计引物PCR扩增啊，要测序码，怎么知道转录因子结合的序列？不懂

根据你目的基因的某一段序列设计引物，普通引物就可以，然后用ChIP拉下来的作为模版，如果扩到了就说明有结合，当然了，如果想得到确切结论一定要设置好阴性对照和阳性对照才可以 至于怎么知道转录因子结合的序列，如果没人做过，没有文献支持，那是需要预测的。