RNA连接酶不可以切断氢键，主要原因是解旋酶能使氢键断裂，RNA聚合酶是使核糖核苷酸间形成磷酸二酯键，而氢键是双链间碱基之间的作用，因此无法切断氢键。图示：
需要注意：RNA聚合酶不可以充当DNA解旋酶，它与启动子结合后，在特定区域将DNA双螺旋两条链之间的氢键断开，使DNA解旋，形成单链区，以非编码链为模板合成RNA互补链的过程就开始了。
RNA连接酶定义：真核细胞RNA前体形成成熟的功能RNA分子时，需要经过剪切和连接过程.RNA连接酶可能在此过程中起连接作用。真核细胞RNA前体形成成熟的功能RNA分子时，需要经过剪切和连接过程。RNA连接酶可能在此过程中起连接作用。
RNA连接酶与DNA连接酶的区别：RNA聚合酶是在转录的时候，以核苷酸为原料，DNA的一条链为模板，合成RNA的酶RNA连接酶是可以识别特定RNA序列，将两端RNA链接起来的酶。
