液相色谱峰形分叉跟手动进样器残留污染有关系吗?

应该没有。
液相是极性相近的物质出峰位置相似。你的残留残留的是什么物质？怎么可能正好出现在你色谱峰的位置？正好出现叉峰？

你应该排查一下其他原因，比如说溶剂。溶剂最好选择流动相，不要选择纯的有机相容剂。因为极性不同，pH值不同，样品从有机相溶剂过渡到流动相就可能出现叉峰。
另外就是看一下你的色谱柱。如果色谱柱填料塌陷也会出现叉峰的问题。你可以拿去标定一下，也可以换一根色谱柱用原方法试试。