本题考查醌类化合物的结构与分类。紫草素的结构类型属于萘醌，丹参酮IIA的结构类型属于菲醌，羟基茜草素的结构类型属于蒽醌。菲醌的代表化合物丹参中的丹参酮IIA、丹参酮IIB。C项正确。
A项：苯醌的代表化合物紫草中的arnebinol、arnebinone。与题干不符，排除。
B项：萘醌的代表化合物紫草中的紫草素、异紫草素。与题干不符，排除。
D项：蒽醌的代表化合物大黄中的大黄素，属于大黄360问答素型，茜草中的羟基茜草素，属于茜草素型。与题干不符，排除。
E项：三萜的代表化合物人参中的人参皂苷Re。与题否新干不符，排除。
故正确答案为C。
