HBV的基因组是一个赵有部分单链区的环状双链DNA分子，两条单链长度不同。长链L(3.2kb)为负链，而短链饭香S为正链，基因组依靠正链5'端约240bp的粘性末端与负链缺口部位的互补维持院张解春严杂了环状结构。在两来自条链的互补区两侧各有一个11碱基的直接重复序列(5'-TTCAC-CTCTGC-3')，分别开始于第1842和1590核苷酸处，称为DR1和DR2。
S编码区编码乙肝表面抗原蛋白，分别编码由226个氨基酸残基的表面抗原主蛋白(SHBS)、108-115个氨基酸的原S1蛋白和55个氨基酸组成的原S2蛋白3部分组成。
P编码区长2532碱基，约占全基因组3/4乡以上，是最长的编码区，包含全部S编码区并与C和X编码区有部分重叠。P编码区由3个功能区和一个间隔区构成，可能先翻译成9.5×105多肽，然后加工成较小的功能型多肽。
C编码区。该区长639碱基，翻译产物为病毒核心抗原(HBcAg)。其原初翻译产物是前核心蛋白，切除N端19肽和富含精氨酸的C末端后，成为E抗原(HBeAg)。
X编码矛区。是最小的编码区，编码x蛋白，覆盖了负链的缺口部位，虽然长度不等，但主要产物由154个氨基酸残基组成。[考点]HBV病毒基因组的结构与功能。
