从结构区分，二者化学式不同，相应的分子量也不同：次磷酸钠，分子式NaH2PO2，分子量88亚磷酸钠，分子式Na2HPO3，分子量126从所含结晶水区分：次磷酸钠，含1个结晶水；亚磷酸钠，含5个结晶水从晶形区分：次磷酸钠，以结晶体存在形式居多；亚磷酸钠，以结晶性粉末形式居多。从稳定性区分：次磷酸钠，加热易爆炸，不稳定亚磷酸钠，加热稳定从化学性质区分：次磷酸钠，有强还原性，易与氧化剂反应亚磷酸钠，无还原性，不与氧化剂反应从毒性区分：次磷酸钠，加热易放出有毒的磷化氢，属易制毒品亚磷酸钠，无毒性
