羟自由基是自由基，而羟基是官能团，结构上没什么区别，但是自由基是化学反应中的中间体，可以短暂地独立存在，而官能团是原子团，是某个分子中的一部分，不能独立存在。
另外，自由基由于能量很高，其孤电子往往处于激发态。
