宏基因组测序 找到16s相似序列吗

一、16S测序原理16SrDNA基因存在于所有细菌的基因组中，具有高度保守性。然而该基因序列还包括9个高变区（V1-V9），通过特异性引物对某一段高变区（如V3区）或某几段高变区（如V3-V4区）进行扩增测序，然后与数据库比对，可特异性识别细菌种类。二、宏基因组测序原理将基因组DNA随机打断成若干条500bp的小片段（类似于拼图中的单个形状不一的治血要终氧模块），然后连接接头（双端120bp），在片段两端加通用引物进行PCR扩增测序。将reads进行组装拼接（类似于将众多模块拼成一副完整图片），得到基因序列，众多基360问答因构成完整的基因集。同时将获得的reads片段或组装好的基因序列与NCBI数据库进行比对，得到物种注释结果。对于16S测序而言，任何一个高变区或几个高变区，尽管变异性再高，对于某些物种来说，这些高变区也可能十分相近，而能够区分它们的特异性序列片段有可能不在我们的扩增区域内。换言之，非全长的可变区成流文波赶序列覆盖范围不够导致无法鉴象汽异定到种。宏基因组在建库之前会先将基因组DNA随机打断成若干小片段，而这些话答去克整门服小片段中总有一些能够包含区分2个物种的基因差异序列。由于测序深度足够深，相当氢石夜督有乱于覆盖了整个基因组的信息，因此在与NCBI数据库比对省标时，就能够注释到相应的种水平的物种。