rna-seq检测完整性的方法?

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少量样品进行琼脂糖凝胶变性电泳,样品应有清社曲最又史变晰完整条带,无弥散。不同物种总RNA条带不同,在网上可以查到相关对照。另外,个别物种如某些昆虫,提取方法不同,RNA完整性亦不同。 具体方法,一般情况下取0.级妒室岩毫尔修王态保洋5ugRNA样品,补水至总体积约3~10ul,以4、5uL为佳。加入适量loa景段言门丰项斤技边ding buffer及EB(或其他染色剂)混合。按照RNA样品种类不同配置1.3%~1.7%浓度的琼脂糖凝胶。缓冲液配方网上可查。进行电泳。并在紫外灯下观察条带。 全程保证无RNA酶环境,且越长的RNA分子越容易降解,可依次判断您的总RNA样品完整性。


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