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解：A、根据甲组实验可知，R型细菌可以作为S型细菌的疫苗，A正确；
B、根据乙组实验可知，高温杀死的S型细菌虽然不具有致病性，但扔保留有抗原性，B正确；
C、甲组小鼠2中能够分离出R型细菌，但没有S型细菌，C错误；
D、乙组中小鼠1体内存在着针对S型细菌的抗体和记忆细胞，D正确．
故选：C．
