霉菌有着极强的繁殖能力，而且繁殖方式也是多种多样的。虽然霉菌菌丝体上任一片段来自在适宜条件下都能发展成新个体，但在自然界中，霉菌主要依靠产生形形色色的无性或有性孢子进行繁殖。孢子有点像植物的种子，不过数量特别多，特别小。
霉菌的无性孢子直接由生殖菌丝的分化而形成，者民常见的有节孢子、厚垣孢子、孢囊孢子和分生闹帆丛孢子。
霉菌的有性繁殖过程包括质配、核配、减数分裂三个轿明过程战威历，常见的有性孢子卵孢子、行杂助除保接合孢子、子囊孢子、担孢子。
霉菌的孢子具有小、轻、干、多，以及形态色泽各异、休眠期长和抗逆性强等特点，每个个体所产生的孢子数，经常是成千上万的，有时竟达几百亿、几电道养程甚千亿甚至更多。这些特点有助于霉绍线科诉菌在自然界中随处散播和繁殖。对人类的实践来液樱说，孢子的这望切时派屋误入课稳些特点有利于接种、扩大培养、菌种选育、保藏和鉴定等工作，对人类的不利之处则是易于造成污具染、霉变和易于传播动植物的霉菌病害。
