将需要比对的蛋白质序列选中，在BLAST界面Enter Quer同y Sequence下面的大框宣诉铁可愿研中输入，如果是和数据库所有的蛋白质序列进行比对，再下面的Choose Search Set中选择需要比对来自的数据库。Program Selection中的比对可根据个人需要进行盐独家宗双强或草曾在选择。
如果进行两两比对，或者多个序列的比对，在Enter Query S输菜该纪困批够equence框中选中Align two or more sequences，在弹出的框中，输入你需要比对的序列，最后点击BLAST即可。
结果得分越高，同源性越高，E值是期望值，得分越低同源性越高
扩展资料：
由仍查棉甲东镇于进化上或个体发育上的共同来源而呈现的本质上的相似性，但其功能不一定相同，如狗的前肢和鸟的翅。从分子水平讲则是指两个核酸分子的核苷酸序列或两个蛋白质分子的氨基酸序列间的相似程度。虽然同源性须通过序列测定来检验，但是DNA-DN360问答A或DNA-RNA杂交可提供有价值的估计。
参考资料来源：百度百科-同源性
