分类（依应用）
有机质谱仪-测定有机化合物的分子结构
气相色谱-质谱联用仪（GC-MS）
液相色谱-质谱联用仪（LC-MS）
基质辅助激光解吸飞行时间质谱仪（MALDI-TOFMS）
傅立叶变换质谱仪（FT-MS）
无机质谱仪–测定无机化合物
火花源双聚焦质谱仪（SSMS）
感应耦合等离子体质谱仪（ICP-MS）
辉光放电质谱（GDMS）
二次离子质谱仪（SIMS）
同位素质谱仪–测同位素丰度
气体分析质谱仪-主要有呼气质谱仪，氦质谱检漏仪
分类（根据质量分析器）
双聚焦质谱仪
四极杆质谱仪
飞行时间质谱仪
离子阱质谱仪
傅立叶变换质谱仪等
