蛋产出后，蛋壳表面很快就沾有粪便、垫料感染了病原微生物，这些病原微生物的繁殖速度很快。据研究，刚产出的蛋，蛋壳表面细菌数为100～300个，15分钟后为1000～3000个，厚垫料饲养的种鸭激神四料经谈投产蛋1小时后蛋壳表面细菌数甚至可达20000～30000个。种蛋受到污染后不仅影响到自身的孵化率，更严重的是污染了孵化机和用具，传染各种疾病。因此蛋产出后，除及时收集种蛋外，持正量还应立即进行消毒处理（种蛋不宜洗，更不能用刷子刷洗蛋壳），以杀灭蛋壳表面附着的病原微生物。常用的消毒方法有以下几种：（1）福尔马林熏蒸法 这是当前使用比较普遍的一种消毒方法，既方便，消毒效果又好，适用于密封性能较好、带风扇的小型蛋房。按每立方米空间，先在一广口瓷盘或器皿中加入15克高锰酸钾，注意要均匀摊平，同时将30毫升福尔马林（40%的甲醛溶液）倒入一口径较大的容器（如茶杯）中，然后迅速倒入装有高锰酸钾的洋校套功广口瓷盘或器皿中，随即关闭门窗熏蒸消毒20～30分钟后，打开门窗，开动风扇，尽快排出清井合秋须听损她权毒气体。消毒时，室内温度应保持在24～28℃，相对湿度维持在75%～80%，在这种条件下的消毒、杀菌效果最佳，可杀死蛋壳表面的细菌、芽孢和病毒。由于福尔马林和高锰酸钾反应剧烈，作用后产生的气体对人有刺激性，使用时应加以防护，避免束棉接触到皮肤或吸入而给人体造成伤害。此方法对外表清洁的种蛋消毒效果较好，对外表沾有粪便或其他污垢的脏蛋消毒效果不良。由于福尔马林和高锰酸钾的价格较贵，为了节省消毒成本，可将蛋架或蛋托用塑料薄膜包裹密封后熏蒸消毒，也可用0.01%的臭氧溶液代替福尔马林进行熏蒸消毒。（2）溶液浸泡消毒法 将种蛋排列在蛋架上，用5%新洁尔灭加50倍水配成0.1%的水溶液，对种蛋表面进行喷雾消毒，待种蛋晾干后送蛋库贮存或入孵。也可将种蛋放入40～50℃的0.1%新洁尔灭溶液中浸泡3～5分钟后取出，晾干后入孵。该方法使用较为方便，但应注意，不得与肥皂、高锰酸钾、碘、碱等物质联用，以免药液失效。也可将高锰酸钾配制成0.02%溶液（即在50千克水中加入10分修责儿善行袁声克高锰酸钾），然后把种蛋浸泡在石告渐院本客清医稳林40℃的溶液中浸泡2分钟左右，取出滤干后即可入孵。还可用50%的百毒杀（双癸基二甲基溴化铵溶液）3毫升加10升水后配成消毒液，对种蛋进行喷雾消毒2～3分钟。因百毒杀价促交术协格便宜，无腐蚀性，毒性小，使用安全简便，深受广大养鸭户的喜爱。使用浸泡法对种蛋进行消毒时，一般蛋壳的胶膜会受到不同程度的损伤，因此经浸泡法消毒的种蛋一般不宜送到蛋库保存，而应直接入机孵化。（3）紫外线消毒法 在离蛋的表面1米左右处安装一盏40瓦的紫外线灯管，照射种蛋10～1教显富压木5分钟即可。但此方法的消毒效果较差，生产中不常采用。
