3-甲基吲哚具有令人不愉快的粪臭味，但经大量稀释后有愉快的香味，特别具有灵猫香基的香韵，在干酪、坚果、葡萄等制品中加入少量就有效果，在海味香精中加入，可具鱼肉味，另外在一份1994年五家香烟大厂的报告中，粪臭素被列为599种香烟添加物之一，作为香料使用。此外可作医药中间体，定香剂 吲哚美辛肠溶片
