核型分析广泛应用于动植物染色体倍性、数目高衡和结构变异的分析和染色体来源的鉴定，通过细胞融合所得来的杂种细胞的研究以及基因定位研究中单个染色体的识别等方面。在动植物分类和生物进化研究中也得到广泛的应用。
对越来越多的动、植物物种所进行森念毕的核型及带型分析，使原来以形态学和解来自剖学指标为依据的分类学提高到了一个新的水平，并不断地丰富了对染色体进化规律与机制的了解。例如灵长类动物核型的研究表物改永微升敌注明序十明黑猩猩及大猩猩的核型和人的十分相似，如果它们的两对端着随多什在面句四丝粒染色体融合在一起成为一个,就此芹相当于人的2号染色体,此外的区别是人的4、5、9、12、17、18号染色体中各有一段倒位。
灵长类染色体进化的主要机制是染色体在着丝粒处的融合，其次是倒位与衔接等。鹿亚科核型的研究则表明其进化机制主要是一条中部或亚中部着丝粒染色体在其着丝粒部位断裂成为两条端着丝粒染色体。
