PCR荧光定量

用MX-3000做荧光定量PCR,我的质粒用SYBR染料做标准曲线,为什麽CT值总在28-30之间,扩增效率都800以上了,做标准曲线老做不出来,质粒都重复稀释好多次了,我从1ng每微升到1fg每微升稀释7个梯度,最小ct值老是在26以上,间隔也很小,都在0.4左右,且没规律,急求好心人帮忙。
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间隔也很小,都在0.4左右-----估计你没有扩出目的DNA片段,检测到的信号都是引物二聚体跟SYBR结合的结果。 我怀疑你的PCR条件还没调整至最佳条件。你先用浓度最大的那个质粒做模板,进行定性PCR,然后跑电泳,观察是否有目的条带,是否有引物二聚体。记住,有引物二聚体的话,引物二聚体就会和SYBR结合,这样做realtimePCR是不准的。一定要调整至没有引物二聚体,可以考虑提高退火温度及降低引物浓度。 调整好之后,质粒用PCR水做10倍梯度稀释(比如4微升稀释至40微升),如果扩增效率没问题的话,理论上质粒浓度每差10倍,其ct值就相差3.3。另外,如果体系调整好之后,你的质粒最小的还是在26以上的话,最低只能稀释到100倍了,再低就做不出来了

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CT值那么高,应该是没有扩增出目的片段,建议重新设计一下引物以及检查模版,然后做优化。
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