在消毒以前，首先要对孵化盘和出雏盘用水浸泡，用钢丝刷除掉雏禽胎粪、血斑、蛋壳碎片及蛋的内容物污染处，再用清洁消毒液浸泡，然后用清水冲洗干净，沥干后备用。
孵化机（包括孵化箱与出雏箱）用水冲洗后，可喷洒3%来苏尔观液，也可用福尔马林溶液熏蒸消毒。方法是技每立方米容积用福尔马林30毫升，高锰酸钾15克。先将所有通气孔盖关闭，水盘加水，孵化机内保持正常的孵化温度，相对湿度在70%左右。然后将高锰酸钾放通好于茶视实在瓷器皿内，置孵化机底部，再倒入福尔马林溶液后，立即关闭机门，开动风扇无济端往但跳鼓风。经30分钟后，打开机门与所有通气孔盖，继续鼓风，使气体外逸。孵化机应用八方载市千此法消毒效果较好。
