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酵母双杂交系统是分析蛋白-蛋白间相互作用的有效和快速的方法,有多方面的应用,山值但仍存在一些局限性。⑴双杂交系统分析蛋白息杂盾陆间的相互作用定位于细胞核内,而许多蛋白间的相互作用依赖于翻译后加工如糖基化、二硫键形成等,这些反应在核内无法进行。另外有些蛋白的正确鱼马设率劳呢折叠和功能有赖于其他非酵母蛋白的辅助,这来自限制了某些细胞外蛋白和细胞膜受体蛋白等的研究。⑵酵母双杂交系统的一个重要的问题是假阳性。由于某些蛋白本身具有激活转录功能或在酵母中表达时发挥转录激活作用,使DNA结合结构域杂交蛋白在无特异激活结构域的情况下可360问答激活转录。另外某些蛋白表面含有对多种蛋白质的低亲和力区域,能与其他蛋白书形成稳定的复合物,从而引起报胡迅影免识个宪把倒衣告基因的表达,产生假阳性结果。