1、作用底物不同。RNA聚合酶底物是NTP；DNA聚合酶底物是dNTP。2、RNA聚合酶作用不需要引物，而DNA聚合酶作用需要引物。3、RNA聚合酶本身具有一定的解旋功能，而DNA聚合酶没有，当需要更陈打南解开双链的时候要解旋酶和区水沙应扬与儿拓扑异构酶的帮助。4、RNA聚合酶只具有5‘到3’端的聚合酶活性，而DNA聚合酶不仅有5‘到3’端的聚合酶活性，还具有3‘到5’端的外切酶活性。保证DNA复制时候校对，所以复制的忠实性高于转录的。RNA聚合酶通常作用于转录过程；DNA聚合酶金司拿露包求且铁易送通常作用于DNA复制过程。
