茚三酮测定氨基酸含量缺点：用茚三酮比色法测定游离氨基酸含量与真实值相比其结果是偏高的。
优点：茚三酮与氨基酸中氨基反应形成蓝色至紫红色的物质，但蛋白质或者多肽中也含有氨基残基，也会和茚三酮反应，也会生成有色的物质，比色过程中也会有吸收。因此该方法测定游离氨基酸含量与真实值相比其结果是偏高的。
反应机理
除脯氨酸、羟脯氨酸和茚三酮反应生成黄色物质外，所有的α-氨基酸及一切蛋白质都能和茚三酮反应生成蓝紫色物质。该反应分两步进行，首先是氨基酸被氧化，产生 CO2 、NH3和醛，而水合茚三酮被还原成还原型茚三酮；第二步是所生成之还原型茚三酮与另一个水合茚三酮分子和氨缩合生成有色物质。
