如何查找 蛋白质相互作用作用 结构域

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去blast里面查询,Specialized BLAST里面的“Search protein or nucleotide targets in PubChem BioAssay”,点击protein链接,把序列输入里面查询就可以了。 结构域是生物大分子中具有特异结构和独立功能的区域,特别指蛋白质中这样的区域。在球形蛋白中,结构域具有自己特定的四级结构,其功能部依赖于蛋白质分子中的其余部分,但是同一种蛋白质中不同结构域间常可通过不具二级结构的短序列连接起来。蛋白质分子中不同的结构域常由基因的不同外显子所编码。

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首先要确定两个蛋白质之间有相互作用 再去寻找结构域,可以用的方法有 研究文献,如果有晶体衍射做出的相互作用结构域的报道,那么一定要仔细研究 要研究清楚目的蛋白的三级结构,比如螺旋、片层的蛋白起始和结束位点确定研究方法,常用的有酵母双杂交,免疫共沉淀等 做缺失突变体,可以从N端和C端逐一截掉氨基酸 还可以将中间比较重要的氨基酸序列全部删除 利用重叠PCR的方法就可以获得DNA序列
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