将你需要比对的蛋白质序列选中，在BLAST界面EnterQuerySequence亮矿交和内下面的大框中输入，如果是和数据库所有的蛋白质序列进行比对，再下面的ChooseSearchSet中选择你需要比对的数据库。ProgramSelection中的比对可根据个人需要进行选择如果进行两两比对，或者多个序列的比对，在EnterQuerySequence框中选中Aligntwoormoresequ极示兰斯ences，在弹出的框中，输入你需要比对的序列最后点击BLAST即可。结果得分越高，同源性越高，E值是期望值，得分越低同源性越高
