常规的做法是先洗涤包涵体，包涵体的洗涤通常选用浓度较低的变性剂，如2M尿素在50mM Tris，pH7.0-8.5，1mM EDTA中洗涤包涵体。此外可以用温和去垢剂TritonX-100洗涤去除膜碎片和膜蛋白。同时，因为去垢剂的洗涤能力会随溶液离子强度升高而加强，所以在洗涤包涵体时可加入低浓度的尿素或高浓度的NaCl，使包涵体的纯度达到50%以上。洗涤完之后，再将包涵体用高浓度的变性剂进行溶解，将溶解的变性蛋白过柱子纯化。还有的就是省掉洗涤包涵体步骤，直接用变性剂溶解后，然后去纯化。不过这种一般比较适合带有亲和标签的蛋白，如His标签。上海纽普生物他们做蛋白复性还是很有经验的，据说他们的技术人员以前都是搞蛋白质结构的。
