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糖基化程度的分析过程大致如下:首先是鉴定糖蛋白,即确定糖蛋白的存在;其次是富集糖蛋白,即糖蛋白的分离存化。
糖蛋白的检测大致有以下几种:放射性标记法、分子荧光标记法、电泳法、凝集素标记法、抗体标记法和化学酵素法。
获得糖基化蛋白的方法主要是电泳法和层析法。电泳法即通过电泳的方法先得到糖蛋白条带或蛋白点,再通过电洗脱或透析的方法得到糖蛋白。此方法较为费时,且在操作中易使蛋白变性。而层析法则具有快速、准确、分辨率高、稳定性好等特点,是分析糖蛋白的理想手段。目前,利用抗体、凝集素进行亲和层析已成为分离存化糖蛋白的主要方法。
糖基化氨基酸位点的鉴定中,Edman降解法冗长,需要高超的实验技巧和较多的蛋白质,且无法处理N-端封闭的蛋白质。因此,随着质谱技术的发展,此法已不在被广泛使用。核磁共振技术也可用于糖基化氨基酸位点的鉴定。这种方法可在液态溶液中直接进行蛋白质结构测定。糖链结构的鉴定也采用质谱技术、毛细管电泳技术、气相色谱技术及凝集素亲和技术。