1. 明确试验目的
2. 设定实验题目
3. 设计试验方案
4. 准备实验材料
5. 着手进行试验
6. 纪录试验结果
7. 分析实验纪录
8. 讨论
9. 结论
10. 送交有关机构审查论文
以上是做科学试验最基本的程序，至于制备蛋白质的具体问题，可以根据生物化学教学大纲的要求和实验课的安排予以考虑如下：
1. 蛋白质的等电点
2. 溶液的Ph值
3. 制备时的反应温度
4. 是否做盐析
5. 溶液中离子浓度的控制
6. 定量检测方法（凯氏定氮、分子电泳或其它方法）
7. 其它
