氨基酸序列比对原理?

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序列比对(alignment):为确定两个或多个序列之间的相似性以至于同源性,而将它们按照一定的规律排列。术语“序列比对”也指构建上述比对或在潜在的不相关序列的数据库中寻找significant alignments。

基本信息

用途语言进化的研究理论基础进化学说重要性对算法的研究具有非常重要的意义

正文

序列比对(alignment):为确定两个或多个序列之间的相似性以至于同源性,而将它们按照一定的规律排列。

将两个或多个序列排列在一起,标明其相似之处。序列中可以插入间隔(通常用短横线“-”表示)。对应的相同或相似的符号(在核酸中是A, T(或U), C, G,在蛋白质中是氨基酸残基的单字母表示)排列在同一列上。

这一方法常用于研究由共同祖先进化而来的序列,特别是如蛋白质序列或DNA序列等生物序列。在比对中,错配与突变相应,而空位与插入或缺失对应。序列比对还可用于语言进化或文本间相似性之类的研究。

术语“序列比对”也指构建上述比对或在潜在的不相关序列的数据库中寻找significant alignments。


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