质粒的同源重组是什么原理？

那就要看是什么菌种的，有些菌种是重组酶缺陷的，比如TOP10、stbl3等等，有些菌种表达重组酶，只要有同源序列，就容易发生重组。你要好好看看菌种的说明书，看看是不是重组缺陷的。