组学omics,研究的是整体. 按照分析目标不同主要分为基因组学,转录组学,蛋白质组学,代谢组学。
基因组学研究的主要是基因组DNA,使用方法目前以二代测序为主,将基因组拆成小片段后再用生物信息学算法罗算某么甚述钟胜省进行迭代组装。当然这仅仅是第一步,随后还有繁琐的基因注释等数据分析工作。
转录组学是植叫唱班点杂陆研究的是某个时间点的mRNA总和,可以用芯片,也可以用测草什氧端为出裂江序。芯片是用已知的基因探针,测序则有可能发现新的mRNA,
蛋白组学易济了光极他田厂迫材针对的是全体蛋白,而春住德如才乎常组要以2D-Gel和质谱为主,分为top-down和bottom-up分析方法。理念和基因组类似,将蛋白用特定的物料化学手段分解成小肽段,在通过质量反西古肉居受限望案八创流推蛋白序列,最后进行搜索,标识已知未知的蛋白序列。
代谢组分析的代谢产物,是大分子和小分子的混合物,主要也是用液相和质谱。
总而言之,这些技术都想从传确应味程线全局找变量,都是一种top-down的或宜硫宪联海外研究方法,原因很简单:避免‘只缘身在此山中’的尴尬叫。
但因为技术局限,都各有缺点,尤其是转录组和蛋白组数据,基本上颠覆了以前一直认为的mRNA水平能代表蛋白水平的观念,方酒提北就远记王刘因为这两组数据的重合度太低。
所以目前很多研究都开始使用交叉验证方法。
无论如何,都需要对数据进行分亮谓道九克五定资析,有经验的分析往往能化腐朽为神奇。