rna免疫共沉淀分离得到rna会像染色质免疫共沉淀分离得到的DNA那样变成短的片段吗

从整个实验过程来看，在RIP里面没有像ChIP里面那样，有一个超声打断长染色质片段的步骤，分离得到的RNA理论上应该是保持了原有的长度。但是虽然整个反应系统是要求严格无RNase干扰的，RNA本身的一些不稳定性可能会有一些影响。 最主要的还需要根据你分离的目标RNA有关，如果本身抗体捕获的蛋白就只能和microRNA或小RNA结合，就只能看到小片段。如果目标是一些lncRNA的，有可能会分离到较大的片段，前提是RNA没有降解。