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感谢关注: oddxix 得到下机数据后,我们先要进行数据质控,看一下数据质量 数据质量主要从两方面去分析:碱基含量分布和碱基质量分布 测序的GC含量应该与物种的GC含量相同 碱基含量分漏缓念布异常 注:样品为混合样品或者测序一次样品不能够饱和等原因造成的波动是可以忽哪冲视由晶商皮皮名鸡花林成波的 评价标准 错误率和质量值返困的对应关系 纵修团轻假程答水坐标是质量,横坐标是reads RNAseq中的duplication不是打断不随机造成的,而是由于基因的表达差异。去除duplic育讲ation会造成丰度信息的丢失,于是在RNAseq定量分析中不能去duplication.但在没有参考基因组的情况下需要对序列进行拼接,此时又需要去duplicatio致n。 不要求100%精确,原则是不影响后续分析,可以根据最终结果,重新过滤数据
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