碘的杀菌作用十分强大，它能杀细菌、芽孢、病毒、噬菌体等病原体。

含碘消毒剂是中效消毒剂，不能杀灭细菌芽孢，但能杀灭细菌繁殖体（包括结核分枝杆菌）、真菌和大多数病毒。